NJK-Web er gruppen som drifter og utvikler NJKs nettsider. Dette lå tidligere under NJK-Forskningsavdelingen, men webavdelingen ble skilt ut som en egen avdeling 4. november 2004. Det er et utstrakt samarbeid med Forskningsavdelingen som står for NJKs web-tilbud Stasjonsdatabasen, Materielldatabasen, Stedsdatabasen og Fotosamlingen.

Web-avdelingens medlemmer er i januar 2011:

Svein Sando, databasemekker og midlertidig leder
Mikael Dalsgard, systemansvarlig
Rolf Marthin Nilsen, medlem